Panji-Panji Sultan Johor, Permaisuri Johor dan Waris-Waris
Bendera Johor kesemuanya berjumlah 24 dapat dibahagikan kepada tiga kumpulan. Pertama merupakan kumpulan bendera berkenaan dengan raja. Bendera dalam kumpulan ini terdiri daripada sebelas bendera seperti di bawah:
Bendera Sultan Johor | Bendera Permaisuri Johor | Bendera Tunku Mahkota |
Bendera Tunku Bendahara | Bendera Tunku Temenggong | Bendera Tunku Laksamana |
Bendera Tunku Panglima | Bendera Tunku Putera | |
Bendera Kerabat Diraja | Bendera Istiadat Kerajaan | Bendera Pengiring Raja |
Bendera Negeri dan Bendera Kerajaan Johor
Kedua dan ketiga, kumpulan terdiri daripada bendera yang berkenaan negeri dan pegawai kerajaan, iaitu
Bendera Negeri Johor | Bendera Pemangku Raja | Bendera Menteri Besar |
Bendera Pemerintah Askar Johor | Bendera Pesuruhjaya Kerajaan bagi Muar | Bendera Pesuruhjaya Kerajaan bagi Batu Pahat |
Bendera Pesuruhjaya Kerajaan bagi Segamat | Bendera Perniagaan | Bendera Askar |
Bendera Polis | Bendera Jabatan Laut | Bendera Tetunggal Jabatan Laut |
Bendera Tetunggal Kapal Kerajaan |